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            專利數據庫助力科技“抗疫”

            瀏覽: 時間:2018-07-02 分類:行業資訊
            在藥物研發人員檢索數據庫時,除了檢索物質的屬性信息外,化合物的制備方法也非常重要,比如藥物A由3步反應得到,每一步由哪些反應物發生什么反應反應條件是什么,這些信息應當在標引過程中給予重點關注

              今年突如其來的新冠肺炎疫情給中國乃至全世界帶來了嚴峻的考驗,截至目前,病毒陰霾仍未消散,藥物和疫苗研發仍然在緊鑼密鼓地開展,各類新藥、疫苗及各類臨床研究成果也在相繼涌現。在新藥研發過程中,如果科研人員擁有相對完善的藥物和化合物數據庫,就可以在基于經驗的以病原體為研究出發點的基礎上,同時以具有相關或可能療效的化合物及其結構為出發點,迅速從多個角度鎖定對冠狀病毒有針對性的目標化合物或類似結構化合物,從而加快藥物研發的進程,提高藥物研發的成功率。

             

              本文以現有新冠肺炎藥物的研發為例,對藥物數據庫標引規則的制定進行分析,并借鑒國內外醫藥化學類數據庫的標引內容給出建議,以期為藥物專利數據庫的建設提供參考。

             

              雜環化合物的標引作用突出

             

              新冠肺炎藥物的研發目前有很多相關成果,例如瑞德西韋、法匹拉韋、磷酸氯喹等。今年10月,美國食品藥品管理局剛剛批準了瑞德西韋用于新冠住院患者的臨床治療,成為美國首個正式獲批的新冠治療藥物。

             

              瑞德西韋的分子結構屬于典型的多手性中心雜環化合物,這也是眾多治療冠狀病毒藥物的共同特點。與此同時,幾乎所有的藥物都含有雜環,治療領域包括而不限于心腦血管和代謝疾病、中央神經系統疾病、抗癌、抗炎、抗潰瘍、抗病毒感染等等。由此可見,雜環化合物不僅在新冠肺炎的治療,同時在各類常見或罕見病癥的藥物發現和藥物研究中均起著極其重要的作用。因此,在后疫情時代的藥物專利數據庫建設中,雜環化合物的標引方法也必將成為重中之重。

             

              雜環化合物是分子中含有雜環結構的有機化合物。構成環的原子除碳原子外,還至少含有一個雜原子,是數目最龐大的一類有機化合物。雜環化合物的標引過程中,分類方法需要給予重視,以便于研發人員在檢索過程中快速縮小范圍。在國際專利分類IPC體系下,C07D屬于雜環類化合物,包含天然產物和合成化合物。天然雜環化合物包括生物堿、類固醇、信息素或性激素、類黃酮、香豆素、維生素、生物素、嘌呤、嘧啶核酸堿、黃素類、木脂素類等。制定標引規則時,可以按照雜原子的種類分類:最常見的雜原子是氮原子、硫原子、氧原子;可以按照環的種類分類:分為脂雜環、芳雜環兩大類;也可以按照環的大小分類:藥物中涉及的雜環化合物主要包括五元雜環、六元雜環和七元雜環;還可以按照雜原子的個數分類:分為含有一個雜原子的和含有多個雜原子的雜環化合物。

             

              國內數據庫標引側重物質屬性

             

              在目前國內藥物專利數據庫建設過程中,化合物的標引一般包括化合物名稱、分子結構式、CAS號、分子量等原文中出現的物質屬性信息。在藥物研發人員檢索數據庫時,除了檢索物質的屬性信息外,化合物的制備方法也非常重要,比如藥物A由3步反應得到,每一步由哪些反應物發生什么反應、反應條件是什么,這些信息應當在標引過程中給予重點關注。例如,五元雜環主要有吡咯、呋喃、吲哚、二唑等及其苯并化物及衍生物,五元雜環化合物的合成方法主要是采用含有雜原子的取代基與活潑的羰基化合物發生縮合反應直接成環或者先縮合再成環。這其中,除了標引化合物名稱等物質屬性信息外,合成反應中反應物的類型和反應類型都應當被重點標引,以便藥物研發人員檢索時能夠快速得到該化合物的合成方法信息,確定合成策略,加快研發進程。再如,前面提到的瑞德西韋,其分子結構中含有多個手性中心。一般來說,含有手性中心的藥物分子只有其中一種構型是有藥理活性的,而實驗證明,瑞德西韋的異構體中,只有S構型具有抗病毒活性。因此,合成過程中涉及的對映異構體的分離方法和不同異構體的抗病毒活性測試就非常重要,在標引過程中要有所側重。

             

              國外數據庫標引重視制備方法

             

              國外重要的醫藥化學類數據庫對雜環化合物的標引相當細化、全面。除了標引化合物名稱、化學結構式、立體構型、CAS登記號等,還要根據雜環化合物的結構和功能給出詳細的分類,同時會給出其在文獻中的位置信息。給化合物分配相關的職能符,以表示化合物在文獻中的存在形式和作用。對雜環化合物的制備方法也相當重視,在標引要點、關鍵詞以及摘要中都有涉及所發生的化學反應類型。這些都是我們可以借鑒的做法。

             

              藥物專利數據庫的建設和完善是一項重要工作,在疫情肆虐全球的背景下,藥物專利標引要點要包含藥物研發需要的重點信息,要更符合研發人員的檢索習慣,以更簡潔、更有利于藥物的系統研發為目標,真正成為科研人員和醫療系統的重要助手,成為提高醫療防控系統應對突發疫情能力的重要保障。


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